在整個ERP理論體系中，MRP就已經能夠解決企業物流管理的問題，但是為了說明企業的經營效益，人們就又將管理會計的理論方法引入ERP軟件中來，從而使ERP軟件有了財務管理的功能。但是ERP軟件的財務管理和一般的財務管理軟件也存在著許多不同之處。

    首先，管理模式不同
    眾所周知，財務管理強調的是事后核算，實際發生原則是財務管理的首要原則，也就是說，它對于企業經營現狀的反映具有滯后性，只能在一切都已經成為事實以后在采取補救措施來調整，這是產生財務信息流、資金流和企業生產經營中的物流產生脫節的重要原因。
    而ERP思想強調的是事前計劃和及時調整，能夠實現企業的三流合一，就是物流流到哪里，資金流就核算到哪里，信息流就反映到哪里，使企業能夠根據市場情況及時反應。
    其次，管理核心不同
    財務軟件管理的核心就是企業的財務狀況，而ERP軟件管理的范圍更加廣泛，而且以降低企業經營成本，提高企業整理競爭能力為目的。
    兩種軟件能夠實現的功能也不同，衡量企業經營效益首先要計算產品成本，ERP軟件產品在核算產品成本方面有著得天獨厚的優勢，成本的實際發生過程，要以ERP系統的產品結構為基礎，從最底層采購件的材料費開始，逐層向上將每一件物料的材料費、人工費和制造費累積，得出每一層零部件直至最終產品的成本。再進一步結合市場營銷，分析各類產品的獲利性。
    而財務軟件由于沒有同生產管理集成，所以難以像ERP軟件這樣方便快捷的核算產品成本，在人力資源管理等方面也是如此。當然，這個也要看企業適合哪種管理模式了，好的不一定適合，一般的也不一定就不合適，不選最好的，只選最合適的。